154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0656 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1306 aa  2701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.07 
 
 		 1068 aa  632  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.87 
 
 		 1055 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  33.3 
 
 		 1139 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.33 
 
 		 1390 aa  466  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.36 
 
 		 1162 aa  417  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.79 
 
 		 1149 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.36 
 
 		 1181 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.46 
 
 		 1265 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 1180 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.11 
 
 		 1171 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.19 
 
 		 1274 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.9 
 
 		 1286 aa  185  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.21 
 
 		 1193 aa  168  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.15 
 
 		 705 aa  161  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.16 
 
 		 1503 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.19 
 
 		 1040 aa  152  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 		 957 aa  152  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 		 951 aa  146  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.48 
 
 		 968 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.71 
 
 		 1027 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.54 
 
 		 1084 aa  132  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.61 
 
 		 868 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.38 
 
 		 1023 aa  124  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  26.22 
 
 		 756 aa  121  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1201 aa  120  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  35.4 
 
 		 669 aa  109  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  36.96 
 
 		 673 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1374  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 410 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.75 
 
 		 759 aa  98.6  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.02 
 
 		 749 aa  98.2  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.19 
 
 		 762 aa  93.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.16 
 
 		 712 aa  91.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  32.04 
 
 		 722 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 		 417 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  32.02 
 
 		 1110 aa  88.2  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  26.21 
 
 		 333 aa  88.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  38.17 
 
 		 373 aa  87.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  26.64 
 
 		 1058 aa  86.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  34.13 
 
 		 147 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.3 
 
 		 864 aa  80.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 		 852 aa  78.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.9 
 
 		 1439 aa  78.2  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  36.44 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  22.69 
 
 		 1141 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  42.98 
 
 		 164 aa  75.1  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  39.32 
 
 		 159 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  38.79 
 
 		 159 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  36.29 
 
 		 150 aa  67.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  34.45 
 
 		 161 aa  68.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  37.93 
 
 		 150 aa  67  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.1 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  35.59 
 
 		 165 aa  65.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  23.67 
 
 		 466 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.5 
 
 		 436 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  24.09 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.77 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  35.11 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  35.11 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  35.11 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  35.11 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 		 430 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  25.38 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 460 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  33.86 
 
 		 162 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 		 241 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.66 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.48 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.97 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  32.23 
 
 		 173 aa  60.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 179 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  22.81 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.48 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.26 
 
 		 773 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 408 aa  57  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  35.88 
 
 		 158 aa  57  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.98 
 
 		 433 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  27.5 
 
 		 430 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 		 316 aa  56.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  23.92 
 
 		 389 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  23.92 
 
 		 372 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  23.92 
 
 		 355 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  24.32 
 
 		 394 aa  56.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  29.87 
 
 		 299 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  31.63 
 
 		 430 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  31.63 
 
 		 430 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  36.08 
 
 		 160 aa  55.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.11 
 
 		 403 aa  54.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.11 
 
 		 403 aa  54.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 473 aa  54.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  28.22 
 
 		 1143 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.27 
 
 		 419 aa  53.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  21.72 
 
 		 371 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.48 
 
 		 380 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  30.4 
 
 		 151 aa  53.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  35.11 
 
 		 158 aa  53.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>