49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0332 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  50 
 
 		 712 aa  708    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 705 aa  1452    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.31 
 
 		 1265 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.63 
 
 		 1171 aa  240  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 		 852 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.46 
 
 		 1274 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.95 
 
 		 1180 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.12 
 
 		 759 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  29.91 
 
 		 756 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.97 
 
 		 749 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.85 
 
 		 1503 aa  187  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 		 762 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 		 957 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.26 
 
 		 773 aa  170  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.43 
 
 		 951 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27 
 
 		 1306 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.24 
 
 		 1193 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.83 
 
 		 1181 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 		 1027 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 		 1068 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.86 
 
 		 1286 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.3 
 
 		 1040 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.13 
 
 		 1055 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  25.77 
 
 		 1139 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.25 
 
 		 1201 aa  131  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.32 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.94 
 
 		 1390 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 		 1162 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.13 
 
 		 1084 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.52 
 
 		 1149 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 868 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.07 
 
 		 1110 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.82 
 
 		 1023 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  30.77 
 
 		 1058 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  31.41 
 
 		 1439 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.39 
 
 		 1141 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  21.93 
 
 		 1143 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  22.77 
 
 		 1142 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  22 
 
 		 1137 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.45 
 
 		 395 aa  51.2  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.67 
 
 		 369 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  46.03 
 
 		 323 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  21.77 
 
 		 436 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  26.39 
 
 		 880 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  46.77 
 
 		 319 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  25.33 
 
 		 369 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.44 
 
 		 666 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 354 aa  44.3  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  24.35 
 
 		 416 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>