111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6210 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  35.06 
 
 		 1110 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  54.31 
 
 		 1143 aa  1249    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  68.34 
 
 		 1137 aa  1626    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  100 
 
 		 1141 aa  2339    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.67 
 
 		 1201 aa  158  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  22.41 
 
 		 1058 aa  136  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.86 
 
 		 1023 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 968 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  24.86 
 
 		 1439 aa  121  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 		 1027 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.08 
 
 		 1181 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1040 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.7 
 
 		 1286 aa  102  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.74 
 
 		 1162 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  25.74 
 
 		 880 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 		 1343 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.93 
 
 		 1274 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.3 
 
 		 864 aa  92.8  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  25.35 
 
 		 874 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.62 
 
 		 1084 aa  89.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.88 
 
 		 868 aa  89.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.97 
 
 		 1503 aa  89.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.63 
 
 		 1149 aa  82  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.75 
 
 		 1148 aa  77.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.62 
 
 		 1265 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.69 
 
 		 1306 aa  75.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.65 
 
 		 1171 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  30.77 
 
 		 902 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  24.2 
 
 		 898 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.05 
 
 		 501 aa  67.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  26.58 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.65 
 
 		 1180 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1224 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  25.53 
 
 		 1139 aa  65.1  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.98 
 
 		 1193 aa  64.7  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.74 
 
 		 466 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.39 
 
 		 705 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  26.04 
 
 		 408 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.6 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1094 aa  62  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25 
 
 		 958 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26 
 
 		 546 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1181 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  23.16 
 
 		 1142 aa  60.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.5 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  23.4 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.5 
 
 		 1390 aa  58.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.86 
 
 		 371 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.75 
 
 		 178 aa  56.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  24.29 
 
 		 168 aa  55.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 831 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.82 
 
 		 192 aa  54.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.93 
 
 		 371 aa  53.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.77 
 
 		 180 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 232 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  26.85 
 
 		 411 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  33.78 
 
 		 924 aa  53.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.27 
 
 		 173 aa  52.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  32.79 
 
 		 254 aa  52.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.65 
 
 		 644 aa  52.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.2 
 
 		 379 aa  52  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.16 
 
 		 399 aa  51.6  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.78 
 
 		 436 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  26.61 
 
 		 410 aa  51.6  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.66 
 
 		 1133 aa  51.6  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2060  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.06 
 
 		 270 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  27.97 
 
 		 1077 aa  51.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  21.62 
 
 		 756 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 381 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 		 384 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.23 
 
 		 491 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.56 
 
 		 1328 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 423 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.37 
 
 		 395 aa  49.7  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  24.1 
 
 		 502 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  23.72 
 
 		 418 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 349 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.8 
 
 		 313 aa  48.5  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  27.07 
 
 		 377 aa  48.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  42.25 
 
 		 1145 aa  48.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.56 
 
 		 253 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  24.89 
 
 		 617 aa  48.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 		 667 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.23 
 
 		 320 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16601  hypothetical protein  35.9 
 
 		 256 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.529095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04441  hypothetical protein  33.96 
 
 		 263 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 1139 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.36 
 
 		 585 aa  47.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.57 
 
 		 168 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  30.83 
 
 		 249 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  26.19 
 
 		 416 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  33.64 
 
 		 273 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  30.83 
 
 		 249 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1054  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.59 
 
 		 273 aa  46.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230439  normal  0.0412138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  25.96 
 
 		 379 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.96 
 
 		 379 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  46.2  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.96 
 
 		 379 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1234 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>