51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2060 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2060  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 270 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0612  HEAT repeat-containing PBS lyase  80 
 
 		 270 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.96054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04441  hypothetical protein  67.18 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1010  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.05 
 
 		 269 aa  291  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  57.68 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16001  hypothetical protein  59.26 
 
 		 269 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16601  hypothetical protein  52.63 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.529095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1573  HEAT repeat-containing PBS lyase  53.39 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16821  hypothetical protein  53.39 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16701  hypothetical protein  52.99 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.175067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.07 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  45.36 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  43.84 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  43.84 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  40.17 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  40.29 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1404  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.61 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  36.44 
 
 		 254 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 1343 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.29 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.98 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1094 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.8 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1224 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  30.24 
 
 		 959 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.28 
 
 		 958 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.81 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.71 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.72 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.33 
 
 		 501 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  26.05 
 
 		 517 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.5 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.57 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.8 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  27.06 
 
 		 1141 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30.26 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.42 
 
 		 180 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1181 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.11 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.78 
 
 		 524 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  30.82 
 
 		 1137 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.25 
 
 		 1133 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.38 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.55 
 
 		 395 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  32.61 
 
 		 838 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  42.25 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.9 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.96 
 
 		 321 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>