169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5008 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 321 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  88.47 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  67.73 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  67.3 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  59.61 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  59.61 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.63 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.33 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.65 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.78 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.45 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  58.45 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.11 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  48.11 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.07 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  46.74 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  44.7 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  47.8 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.33 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  43.04 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.23 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  45.79 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1094 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.17 
 
 		 1343 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.78 
 
 		 1148 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1181 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1224 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 510 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.91 
 
 		 546 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30 
 
 		 958 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.03 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.74 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.61 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.19 
 
 		 1438 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30.7 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.06 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.52 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.12 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.31 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  42.25 
 
 		 838 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.28 
 
 		 959 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.67 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.95 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.15 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.29 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.19 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  41.51 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  36.46 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.85 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.7 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  41.67 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.29 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  33.33 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.52 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.8 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.6 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 		 670 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.67 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.19 
 
 		 1139 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.05 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.12 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.57 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.97 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.14 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.83 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.28 
 
 		 646 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.62 
 
 		 666 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  29.82 
 
 		 646 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 		 642 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 593 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.94 
 
 		 1328 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  28.85 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.02 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.79 
 
 		 220 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  32.61 
 
 		 2216 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.65 
 
 		 220 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  26.55 
 
 		 643 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  33.58 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.13 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  30.13 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  30.13 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  28.85 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.44 
 
 		 641 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.13 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.41 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 		 642 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.07 
 
 		 2194 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.23 
 
 		 831 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  28.85 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  30.13 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>