65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3712 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 283 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1094 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  37.5 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.03 
 
 		 958 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.09 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 1343 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.82 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.57 
 
 		 1148 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.5 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1224 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.91 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.53 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  35.48 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.2 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.4 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.07 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.27 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.59 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.46 
 
 		 1438 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.72 
 
 		 510 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  34.31 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.61 
 
 		 493 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.2 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.07 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 395 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.81 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  34.36 
 
 		 773 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  34.19 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  37.8 
 
 		 1133 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  34.31 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  34.71 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  32.37 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.53 
 
 		 524 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  32.24 
 
 		 522 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  40.82 
 
 		 1058 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.75 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.98 
 
 		 176 aa  46.2  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.18 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.86 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.31 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.23 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.42 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  37.42 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.56 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.08 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 593 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  29.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.32 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.92 
 
 		 666 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  33.52 
 
 		 886 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.5 
 
 		 667 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.58 
 
 		 959 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.68 
 
 		 644 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>