157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0210 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  100 
 
 		 321 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  88.47 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  69.97 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  66.98 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.59 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  59.61 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  59.61 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.59 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.73 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.45 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.43 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  57.43 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.77 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.05 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  46.1 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  45.45 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  44.37 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  43.95 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  45.83 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.67 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.71 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  44.98 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 		 1343 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1094 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.57 
 
 		 501 aa  96.3  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.98 
 
 		 510 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1224 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.33 
 
 		 1148 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.06 
 
 		 958 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1181 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.46 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.72 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.09 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30.52 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.17 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.78 
 
 		 490 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.13 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.83 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.15 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.96 
 
 		 959 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.93 
 
 		 1438 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  35.84 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.12 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.63 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.19 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.65 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.1 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.66 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  40.15 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.1 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.04 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.79 
 
 		 1345 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  32.37 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  33.15 
 
 		 838 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  28.41 
 
 		 1742 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.53 
 
 		 1139 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.19 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.65 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.56 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.06 
 
 		 666 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.25 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.1 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  29.52 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.6 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.8 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.39 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.77 
 
 		 173 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  29.39 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25 
 
 		 2194 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.79 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.57 
 
 		 1133 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.61 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.32 
 
 		 197 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.85 
 
 		 643 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  37.27 
 
 		 886 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.42 
 
 		 524 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.24 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.82 
 
 		 667 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.37 
 
 		 857 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.37 
 
 		 857 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.29 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.46 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  38.94 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  32.76 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  31.19 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  29.33 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.21 
 
 		 670 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.72 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.88 
 
 		 517 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  28.85 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  27.06 
 
 		 1237 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.61 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.31 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>