151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2149 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
390 aa  736    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.84 
 
 
395 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 
1343 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  34.96 
 
 
1094 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.33 
 
 
958 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.81 
 
 
1148 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.69 
 
 
1224 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.69 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.41 
 
 
399 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.54 
 
 
1438 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.23 
 
 
1412 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.76 
 
 
546 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.09 
 
 
493 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.94 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
490 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.96 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.01 
 
 
1181 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.97 
 
 
644 aa  89.7  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.67 
 
 
178 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.09 
 
 
321 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.78 
 
 
959 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.35 
 
 
1041 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.13 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 
170 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  34.02 
 
 
319 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.5 
 
 
838 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.4 
 
 
1139 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.19 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.16 
 
 
1194 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  33.78 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.02 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 
208 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.24 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.81 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.91 
 
 
886 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.8 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.68 
 
 
670 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.98 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  36.14 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  29.16 
 
 
1133 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
593 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  33.18 
 
 
1137 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.3 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 
221 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  33.64 
 
 
522 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.6 
 
 
251 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.16 
 
 
214 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30.68 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 
667 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.65 
 
 
320 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.18 
 
 
192 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36 
 
 
831 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  28.07 
 
 
773 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.92 
 
 
666 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.84 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.76 
 
 
1328 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.81 
 
 
232 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.03 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  30.41 
 
 
643 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.54 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.54 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  27.18 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.01 
 
 
180 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
200 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.02 
 
 
517 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  25.61 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.23 
 
 
175 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  29.69 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.22 
 
 
212 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.86 
 
 
428 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.11 
 
 
224 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.87 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.16 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.92 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.5 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  33.78 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.94 
 
 
646 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.34 
 
 
253 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 
157 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.08 
 
 
951 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  23.81 
 
 
646 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 
173 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.51 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.84 
 
 
1110 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.5 
 
 
176 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.72 
 
 
157 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 
162 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.97 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  26.85 
 
 
218 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.92 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  36.67 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.63 
 
 
199 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.71 
 
 
641 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.68 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.33 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1901  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 
293 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>