130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6151 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  81.76 
 
 		 321 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.88 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  47.73 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  46.43 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.21 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  45.83 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  43.3 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  45.93 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.95 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.11 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.03 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  42.86 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.77 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  43.77 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  42.59 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.73 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.42 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  42.54 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.79 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.75 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.75 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1094 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 		 1343 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.82 
 
 		 501 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.45 
 
 		 1148 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 		 395 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.39 
 
 		 546 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.54 
 
 		 510 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.91 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.38 
 
 		 958 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.07 
 
 		 493 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1224 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.67 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.04 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.1 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.41 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.66 
 
 		 959 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.21 
 
 		 1438 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.03 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.8 
 
 		 1133 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.02 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.68 
 
 		 431 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.77 
 
 		 1328 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.85 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1181 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  27.6 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.6 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.42 
 
 		 1139 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.28 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.57 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.97 
 
 		 173 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.19 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.29 
 
 		 1412 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.48 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  29.3 
 
 		 756 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  35.24 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  32.52 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 157 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  27.83 
 
 		 838 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  27.8 
 
 		 643 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.77 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.4 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.59 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.69 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  30.09 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  25.24 
 
 		 428 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  29.63 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  27.36 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.15 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4786  heat domain-containing protein  29.31 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.85 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 593 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  24.38 
 
 		 541 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.05 
 
 		 670 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  25.9 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5730  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.33 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.11 
 
 		 831 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  25.28 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  27.16 
 
 		 886 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  31.11 
 
 		 2216 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.28 
 
 		 666 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  29.45 
 
 		 773 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.61 
 
 		 667 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.41 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>