215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2016 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
773 aa  1545    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  49.52 
 
 
522 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  35.1 
 
 
1094 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.54 
 
 
1148 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.64 
 
 
1328 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  37.57 
 
 
676 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.13 
 
 
1343 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.51 
 
 
510 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.67 
 
 
1224 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.22 
 
 
838 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  25.49 
 
 
582 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.93 
 
 
580 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  24.93 
 
 
579 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  24.93 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  25.14 
 
 
582 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  25.82 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  25.99 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  24.15 
 
 
582 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  24.58 
 
 
577 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.02 
 
 
1438 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.82 
 
 
831 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 
1181 aa  82  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.32 
 
 
958 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.7 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.59 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  49.46 
 
 
682 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.67 
 
 
1234 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.68 
 
 
546 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.16 
 
 
501 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  26.05 
 
 
575 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.71 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.57 
 
 
493 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.31 
 
 
1110 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  23.63 
 
 
564 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.72 
 
 
448 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  23.63 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  23.63 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  23.63 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.32 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.06 
 
 
644 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.13 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  23.77 
 
 
556 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.06 
 
 
907 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  23.1 
 
 
564 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.36 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.64 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.95 
 
 
1776 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  23.84 
 
 
1049 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  23.42 
 
 
969 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  29.79 
 
 
756 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  43.81 
 
 
321 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.46 
 
 
321 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.67 
 
 
325 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  36.73 
 
 
321 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  34.29 
 
 
320 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.22 
 
 
1475 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.66 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  28.86 
 
 
1237 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  26.3 
 
 
510 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.84 
 
 
370 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  22.63 
 
 
549 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.36 
 
 
2194 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  31.93 
 
 
319 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.09 
 
 
399 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  62  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.16 
 
 
1139 aa  62  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.74 
 
 
751 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  27.23 
 
 
341 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.88 
 
 
768 aa  60.8  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30.17 
 
 
286 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  23.83 
 
 
418 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.87 
 
 
490 aa  60.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  23.92 
 
 
532 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  24.59 
 
 
459 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.29 
 
 
200 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  27.96 
 
 
1133 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.41 
 
 
192 aa  58.9  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.07 
 
 
390 aa  58.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.08 
 
 
1235 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.22 
 
 
428 aa  58.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.73 
 
 
176 aa  57.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.73 
 
 
517 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.72 
 
 
320 aa  57.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.8 
 
 
860 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.63 
 
 
886 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  22.75 
 
 
532 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  24.79 
 
 
383 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.68 
 
 
285 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.57 
 
 
851 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.86 
 
 
1235 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  29.71 
 
 
321 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  24.26 
 
 
386 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  37.14 
 
 
325 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3584  HEAT domain containing protein  29.71 
 
 
375 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.755925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.97 
 
 
180 aa  55.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  21.88 
 
 
553 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.05 
 
 
1284 aa  55.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 
408 aa  55.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.21 
 
 
641 aa  55.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>