32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4394 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 851 aa  1739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.69 
 
 		 831 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.34 
 
 		 1132 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3672  hypothetical protein  37.6 
 
 		 646 aa  297  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1094 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 1343 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.65 
 
 		 399 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.49 
 
 		 510 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1234 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.7 
 
 		 1235 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.24 
 
 		 1475 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.24 
 
 		 1235 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 		 1110 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.19 
 
 		 323 aa  52.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  33.76 
 
 		 838 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 1024 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.09 
 
 		 524 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  22.46 
 
 		 1328 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.73 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.58 
 
 		 921 aa  48.5  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.37 
 
 		 644 aa  48.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.7 
 
 		 958 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 1108 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 621 aa  47.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.83 
 
 		 1138 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 1010 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  23.24 
 
 		 990 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.62 
 
 		 175 aa  44.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.55 
 
 		 493 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  27.48 
 
 		 992 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  26.62 
 
 		 946 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>