70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2128 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 175 aa  341  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.29 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.45 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.43 
 
 		 395 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.16 
 
 		 1412 aa  85.5  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.02 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.26 
 
 		 399 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.94 
 
 		 958 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.2 
 
 		 1343 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  34.12 
 
 		 431 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1094 aa  67.8  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.72 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.29 
 
 		 1041 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1700  metalloenzyme domain-containing protein  31.54 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.973288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.53 
 
 		 1148 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.59 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.16 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 		 490 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.86 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.62 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.57 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.93 
 
 		 493 aa  57.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.53 
 
 		 1139 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.57 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.79 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.38 
 
 		 517 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 		 831 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.87 
 
 		 1438 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2476  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.89 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.39 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  38.14 
 
 		 646 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.53 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.34 
 
 		 851 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.18 
 
 		 646 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.91 
 
 		 1194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.11 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.79 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.6 
 
 		 400 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.58 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.27 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.1 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  31.88 
 
 		 959 aa  47.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  33.11 
 
 		 546 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.84 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  29.57 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  35.51 
 
 		 644 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  41.25 
 
 		 1137 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  43 
 
 		 886 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 		 545 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1181 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  27.81 
 
 		 1133 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  35.87 
 
 		 1141 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  28.18 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 515 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  34.76 
 
 		 515 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.09 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 515 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1874  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.94 
 
 		 311 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 		 464 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  35.71 
 
 		 773 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.53 
 
 		 720 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.07 
 
 		 667 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  31.62 
 
 		 287 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.62 
 
 		 287 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 593 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.88 
 
 		 442 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30.36 
 
 		 286 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1224 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>