40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2476 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2476  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.85 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.91 
 
 		 1412 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.35 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.85 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.08 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.29 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 		 1343 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.34 
 
 		 958 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.81 
 
 		 302 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1094 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.09 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.58 
 
 		 1139 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.97 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1224 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.63 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.07 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.54 
 
 		 101 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.53 
 
 		 501 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  34.78 
 
 		 431 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.87 
 
 		 399 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.36 
 
 		 959 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.26 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 490 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.11 
 
 		 666 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 1181 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.73 
 
 		 232 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.37 
 
 		 517 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.48 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.27 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 		 390 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.16 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.22 
 
 		 101 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.98 
 
 		 246 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.86 
 
 		 557 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  34.07 
 
 		 249 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>