258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0604 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  100 
 
 		 501 aa  999    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  38.39 
 
 		 1094 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.4 
 
 		 1343 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.42 
 
 		 958 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  35.38 
 
 		 493 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.79 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1224 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.85 
 
 		 1148 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.52 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.08 
 
 		 546 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.55 
 
 		 644 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1181 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 		 323 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  28.85 
 
 		 1133 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.63 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.8 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 		 1139 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.8 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.25 
 
 		 1438 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.17 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.57 
 
 		 176 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.18 
 
 		 180 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.6 
 
 		 192 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.77 
 
 		 319 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  32.37 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.25 
 
 		 959 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.45 
 
 		 333 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.82 
 
 		 321 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.72 
 
 		 319 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 517 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.15 
 
 		 1328 aa  90.5  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.57 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.87 
 
 		 838 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.13 
 
 		 331 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  32.13 
 
 		 331 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.08 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.88 
 
 		 331 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.27 
 
 		 1412 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.53 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  32.25 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.92 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.5 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  28.52 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  31.6 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.13 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.49 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.2 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.62 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.62 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  30.91 
 
 		 250 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.21 
 
 		 321 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.41 
 
 		 234 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.48 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  34 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  30.6 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.1 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.67 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.56 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  30.56 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.23 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  32.94 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.54 
 
 		 670 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  27.37 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.33 
 
 		 831 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.16 
 
 		 773 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.52 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  28.05 
 
 		 1141 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  28.04 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  35.58 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.06 
 
 		 224 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  34.67 
 
 		 250 aa  67  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.57 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.04 
 
 		 173 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 200 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.83 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  34.31 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  26.8 
 
 		 832 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 		 1041 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  34.29 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  27.61 
 
 		 1194 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1234 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1404  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.16 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  31.6 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>