28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2420 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  100 
 
 		 832 aa  1721    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2109  hypothetical protein  66.57 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  42.6 
 
 		 944 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2959  hypothetical protein  35.91 
 
 		 913 aa  180  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.347602  normal  0.116718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2713  phosphorylase  63.54 
 
 		 111 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.397901  hitchhiker  0.000424316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 		 1343 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.93 
 
 		 1328 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.48 
 
 		 1148 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.3 
 
 		 958 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.77 
 
 		 2194 aa  81.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1094 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1224 aa  77.8  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  24.65 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1181 aa  55.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.85 
 
 		 510 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 1694 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.46 
 
 		 1004 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 		 1139 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.54 
 
 		 490 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.12 
 
 		 1237 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  25.41 
 
 		 299 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01760  endopeptidase, putative  24.23 
 
 		 1005 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.09 
 
 		 323 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  20.15 
 
 		 1742 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  21.05 
 
 		 1339 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.12 
 
 		 1438 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  25.71 
 
 		 1133 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25 
 
 		 644 aa  44.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>