72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2372 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  100 
 
 
944 aa  1942    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  42.28 
 
 
832 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2109  hypothetical protein  44.92 
 
 
364 aa  296  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2959  hypothetical protein  30 
 
 
913 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.347602  normal  0.116718 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
1185 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08564  Pfs, NACHT, and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G06290)  35.65 
 
 
390 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 
1128 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 
1125 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07363  Pfs domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G00560)  33.11 
 
 
910 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.128389  normal  0.228986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2713  phosphorylase  55.67 
 
 
111 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.397901  hitchhiker  0.000424316 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08611  conserved hypothetical protein  31 
 
 
343 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08542  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
335 aa  98.2  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  30.15 
 
 
1262 aa  94.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08323  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
379 aa  93.6  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341421  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
419 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00793  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 
722 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0479782  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03283  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0579165  hitchhiker  0.00216318 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.18 
 
 
1156 aa  79  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01806  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
783 aa  78.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.275056 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06384  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.840745  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 
1136 aa  73.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.48 
 
 
1131 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11621  hypothetical protein  49.18 
 
 
93 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.170689  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03340  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 
1541 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
1288 aa  65.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.68 
 
 
255 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  25.19 
 
 
403 aa  62  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
1343 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  22.9 
 
 
253 aa  59.7  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08388  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
382 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148957  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.14 
 
 
237 aa  57  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.05 
 
 
458 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10180  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
448 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.53 
 
 
466 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.1 
 
 
459 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  23.38 
 
 
279 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 
526 aa  55.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08533  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
256 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.439178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.1 
 
 
459 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1354  Nucleoside phosphorylase-like protein  28.8 
 
 
547 aa  55.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  25.89 
 
 
508 aa  54.7  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  24.15 
 
 
249 aa  54.3  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.45 
 
 
233 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.45 
 
 
233 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2059  purine phosphorylase family 1  26.62 
 
 
384 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  23.83 
 
 
406 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  22.76 
 
 
233 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.48 
 
 
266 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  25.41 
 
 
493 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1426  nucleoside phosphorylase-like  33.33 
 
 
129 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  24.66 
 
 
1050 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7561  Nucleoside phosphorylase-like protein  32.77 
 
 
296 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.22 
 
 
240 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671323  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  23.64 
 
 
662 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  27.21 
 
 
386 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  22.76 
 
 
233 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  21.88 
 
 
233 aa  48.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.83 
 
 
1148 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.5 
 
 
228 aa  46.6  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08364  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 
232 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  20.56 
 
 
238 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  24.82 
 
 
522 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03557  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
374 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.674205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  24.1 
 
 
302 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0953  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.33 
 
 
251 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  20.94 
 
 
268 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08524  conserved hypothetical protein  72 
 
 
688 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235435  normal  0.0716622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1421  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 
264 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.777512  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1872  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 
265 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170055  normal  0.0118137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1443  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 
264 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0961  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 
264 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4587  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 
264 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>