36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2109 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2109  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  744    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  57.48 
 
 		 832 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  44.92 
 
 		 944 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2959  hypothetical protein  35.09 
 
 		 913 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.347602  normal  0.116718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.76 
 
 		 1148 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.38 
 
 		 1343 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.29 
 
 		 1328 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.2 
 
 		 958 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1094 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  28 
 
 		 2194 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27 
 
 		 1224 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2713  phosphorylase  69.44 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.397901  hitchhiker  0.000424316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.54 
 
 		 192 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  24.89 
 
 		 431 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.01 
 
 		 546 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.19 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 150 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.98 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  22.5 
 
 		 1339 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.11 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.86 
 
 		 1742 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.67 
 
 		 838 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.87 
 
 		 493 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.36 
 
 		 221 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.78 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  26.6 
 
 		 1345 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.13 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  24.4 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.55 
 
 		 667 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  24.37 
 
 		 501 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  27.94 
 
 		 644 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 668 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  26.52 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.65 
 
 		 1139 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.63 
 
 		 1194 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>