93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2119 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
668 aa  1295    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.12 
 
 
666 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.19 
 
 
670 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.24 
 
 
667 aa  361  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.72 
 
 
646 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  36.68 
 
 
646 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.54 
 
 
1343 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.06 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.35 
 
 
1094 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.26 
 
 
546 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  26.11 
 
 
643 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2824  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.79 
 
 
690 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.18 
 
 
690 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 
690 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.02 
 
 
1148 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.12 
 
 
641 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.19 
 
 
1224 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
1438 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.74 
 
 
958 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.88 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.88 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.6 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.03 
 
 
1328 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.38 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.35 
 
 
493 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.61 
 
 
959 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.08 
 
 
302 aa  67  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.22 
 
 
395 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.44 
 
 
1139 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.46 
 
 
325 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.98 
 
 
644 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.61 
 
 
370 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26 
 
 
1133 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 
313 aa  61.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.91 
 
 
334 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.71 
 
 
501 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  29.49 
 
 
218 aa  58.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.5 
 
 
1181 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.11 
 
 
524 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 
208 aa  57.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.72 
 
 
173 aa  57.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.28 
 
 
399 aa  57.4  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.7 
 
 
192 aa  57.4  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.53 
 
 
377 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.42 
 
 
1041 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  31.94 
 
 
381 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 
221 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.77 
 
 
428 aa  53.9  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
593 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.37 
 
 
886 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  29.79 
 
 
357 aa  52  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 
251 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  24.21 
 
 
838 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 
323 aa  50.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  39.13 
 
 
199 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.8 
 
 
1412 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  27.48 
 
 
421 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.36 
 
 
234 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.22 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  36.89 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  32.21 
 
 
1110 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.71 
 
 
375 aa  48.5  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.74 
 
 
223 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.43 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.51 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  27.22 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.82 
 
 
176 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.11 
 
 
200 aa  47.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.87 
 
 
390 aa  47.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  23.47 
 
 
450 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 
180 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 
264 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.87 
 
 
223 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  31.79 
 
 
363 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.96 
 
 
121 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 
219 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  31.96 
 
 
829 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.43 
 
 
824 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0466  HEAT domain-containing protein  33.93 
 
 
254 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.1 
 
 
395 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
522 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 
464 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 
157 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.41 
 
 
220 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.1 
 
 
395 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.51 
 
 
215 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.86 
 
 
1194 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.9 
 
 
331 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  27.78 
 
 
402 aa  44.3  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 
214 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.35 
 
 
821 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.59 
 
 
220 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>