160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1669 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 173 aa  340  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.03 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  49.36 
 
 		 208 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.16 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1094 aa  85.5  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  84.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.09 
 
 		 1343 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.62 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.53 
 
 		 1148 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.9 
 
 		 958 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.01 
 
 		 510 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1224 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.65 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.89 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  34.21 
 
 		 644 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.07 
 
 		 395 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  36.84 
 
 		 546 aa  68.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.89 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  37.04 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  38.76 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  37.33 
 
 		 1133 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.12 
 
 		 1139 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  38.68 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.18 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.27 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.32 
 
 		 524 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.33 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.23 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.27 
 
 		 1438 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.37 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.37 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  34.19 
 
 		 886 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.47 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.97 
 
 		 959 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.62 
 
 		 431 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.67 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.72 
 
 		 668 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  39.1 
 
 		 838 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  38.13 
 
 		 319 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  38.85 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.97 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  33.55 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.96 
 
 		 831 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.04 
 
 		 666 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  37.19 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.62 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  34.27 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.97 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  34.53 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  37.27 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  38.46 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.33 
 
 		 667 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.92 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.99 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.84 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  34.31 
 
 		 402 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.13 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.54 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32 
 
 		 313 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.69 
 
 		 768 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 490 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  29.27 
 
 		 1141 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 641 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 218 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.47 
 
 		 220 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  28.1 
 
 		 316 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.01 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.17 
 
 		 643 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.39 
 
 		 334 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.91 
 
 		 1328 aa  50.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  32.06 
 
 		 321 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.9 
 
 		 1412 aa  51.2  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.4 
 
 		 214 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 		 320 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.12 
 
 		 773 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.12 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.59 
 
 		 1181 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 		 390 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.54 
 
 		 824 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.83 
 
 		 331 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.08 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.58 
 
 		 101 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.8 
 
 		 251 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.08 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  37.61 
 
 		 321 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.38 
 
 		 377 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  29.45 
 
 		 381 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.91 
 
 		 823 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.75 
 
 		 1194 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.87 
 
 		 1216 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  28.03 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 331 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>