58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3413 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 369 aa  715    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  78.06 
 
 		 370 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  45.71 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  39.56 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.42 
 
 		 214 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.95 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.27 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.36 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  37.74 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.45 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  37.93 
 
 		 958 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.48 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  37.4 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.68 
 
 		 1438 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.38 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.27 
 
 		 1139 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  43.02 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.37 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  55.56 
 
 		 524 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  32.43 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.64 
 
 		 666 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.62 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1181 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.73 
 
 		 121 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  36.45 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.64 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.17 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  31.36 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.22 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.25 
 
 		 1412 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  40 
 
 		 959 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.68 
 
 		 1343 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.38 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1224 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  37.8 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.73 
 
 		 192 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.22 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1381  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.35 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.53 
 
 		 157 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  33.68 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.76 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  37.31 
 
 		 164 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0661  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.7 
 
 		 215 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 831 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 		 101 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.21 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  37.11 
 
 		 546 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  41.79 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.51 
 
 		 176 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  31.65 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  34.12 
 
 		 164 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  40 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.18 
 
 		 1041 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>