30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0661 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0661  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
215 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3073  HEAT domain containing protein  58.1 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3047  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  58.17 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5046  heat domain-containing protein  59.42 
 
 
214 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1691  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.68 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2935  HEAT repeat-containing PBS lyase  50.75 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.962071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3484  HEAT domain-containing protein  48.99 
 
 
203 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.438064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1055  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  55.12 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0824539  normal  0.0373773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1912  phycocyanobilin lyase beta subunit  38.05 
 
 
210 aa  121  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.35 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.53 
 
 
1094 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.31 
 
 
493 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.48 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.92 
 
 
644 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.66 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.67 
 
 
1412 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.19 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.7 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.35 
 
 
546 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  30.23 
 
 
218 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.01 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
593 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  36.14 
 
 
958 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  24.89 
 
 
517 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
524 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.72 
 
 
1438 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.49 
 
 
1328 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>