35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1153 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  81.21 
 
 		 510 aa  746    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 509 aa  983    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  32.71 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  30.03 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  50.88 
 
 		 359 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  45.95 
 
 		 368 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  59.72 
 
 		 364 aa  90.1  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  48.72 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  49.33 
 
 		 255 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  25.68 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  25.87 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.71 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  25.3 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  24.9 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.15 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  25.2 
 
 		 773 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.9 
 
 		 751 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.14 
 
 		 616 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.23 
 
 		 907 aa  50.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  40.91 
 
 		 383 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.79 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.85 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  22.81 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.36 
 
 		 860 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  22.89 
 
 		 549 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  38.37 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  26.92 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.57 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.96 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  20.72 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.14 
 
 		 293 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  33 
 
 		 147 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3487  SH3 domain protein  32.99 
 
 		 144 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>