17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3630 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  66.54 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  48.31 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  49.33 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  39.02 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  43.64 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  39 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.43 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  39.02 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  39.06 
 
 		 147 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1381  hypothetical protein  35.34 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.91 
 
 		 474 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 536 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  31.25 
 
 		 938 aa  45.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.68 
 
 		 2449 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3487  SH3 domain protein  35.05 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  43.66 
 
 		 383 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>