17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0977 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 
413 aa  808    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  33.98 
 
 
510 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  31.81 
 
 
509 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  26.15 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  44.16 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  48.53 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  39.47 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  37.86 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.34 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  40.22 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  28.87 
 
 
536 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  40.74 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.97 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  30.91 
 
 
556 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  43.24 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1381  hypothetical protein  33.05 
 
 
186 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
424 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>