15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3597 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 406 aa  800    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  28.11 
 
 		 510 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  29.15 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  49.37 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  25.13 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  44.78 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  44.78 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  27.41 
 
 		 536 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  28.21 
 
 		 532 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  34.25 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  34.72 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 		 815 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.6 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>