53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0391 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  81.21 
 
 		 509 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  985    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  32.46 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  51.75 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  29.24 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  42.74 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  59.72 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  47.44 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  48.65 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  25.88 
 
 		 556 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  26.09 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.49 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.69 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.09 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.46 
 
 		 815 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  26.74 
 
 		 773 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.1 
 
 		 907 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.48 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  21.67 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  21.67 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  21.67 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  21.67 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.37 
 
 		 751 aa  50.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.91 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  37.5 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  22.26 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  22.5 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  35.21 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  29.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  23.97 
 
 		 1281 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  27.61 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  21.57 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.92 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0462  SH3 type 3 domain-containing protein  24.72 
 
 		 1751 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  33.62 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  26.92 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.92 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  26.92 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  26.92 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  26.92 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  26.92 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  31.13 
 
 		 147 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.14 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  28.67 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  26.9 
 
 		 350 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3487  SH3 domain protein  38.82 
 
 		 144 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.33 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.69 
 
 		 432 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.69 
 
 		 413 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  25.65 
 
 		 370 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>