80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0474 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  100 
 
 		 364 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  58.47 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  45.86 
 
 		 359 aa  268  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  52.04 
 
 		 510 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  59.72 
 
 		 509 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.41 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  37.1 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  32.73 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  35.77 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.84 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  49.15 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  34.96 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  41.32 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  39.02 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  43.68 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  35.38 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  35.38 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.9 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  36.15 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  35.54 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  31.88 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  37.1 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  35.29 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  30.11 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.18 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  26.36 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  47.54 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  29.37 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  34.07 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  44.83 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  34.62 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  30.11 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  33.88 
 
 		 493 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  38.6 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  37.72 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  36.71 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  26.32 
 
 		 182 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  27.27 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.29 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  35 
 
 		 260 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  35 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  32.18 
 
 		 201 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.84 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  29.87 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.16 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  35.44 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.47 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  32.79 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  35.4 
 
 		 799 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  35.4 
 
 		 799 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  33.9 
 
 		 498 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  36.67 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  32 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  28.67 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.05 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  33.9 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  30.67 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1903  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 640 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  hitchhiker  0.0000000420934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.5 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  33 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 184 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2800  restriction endonuclease  31.86 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  31.75 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 196 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 178 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  26.6 
 
 		 450 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>