11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2888 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  745    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  73.42 
 
 		 383 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0181  hypothetical protein  30.56 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000347481  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4544  hypothetical protein  23.93 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0092  hypothetical protein  24.86 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  37.5 
 
 		 510 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  34.72 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  38.37 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  42.47 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.11 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  39.13 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>