19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3956 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  66.54 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  37.98 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  48 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  44.16 
 
 		 413 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.46 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  36.29 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  39.2 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  31.58 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  31.54 
 
 		 938 aa  52.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1977 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  47.89 
 
 		 383 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.33 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 536 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1381  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2449 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  39.13 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67464  Ca2+-modulated nonselective cation channel polycystin  32.2 
 
 		 969 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>