44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0403 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 938 aa  1869    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  31.46 
 
 		 400 aa  80.9  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  34.51 
 
 		 491 aa  80.1  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.97 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  31.87 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  27.62 
 
 		 1131 aa  73.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.9 
 
 		 391 aa  74.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.67 
 
 		 404 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  29.49 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  24.46 
 
 		 840 aa  62  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.67 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.72 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24.9 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.16 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  28.37 
 
 		 258 aa  55.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  19.78 
 
 		 870 aa  55.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  38.22 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  28.24 
 
 		 254 aa  52  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  28.93 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  32.08 
 
 		 202 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21500  hypothetical protein  32.56 
 
 		 247 aa  50.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0331455  hitchhiker  0.0000576251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2474  hypothetical protein  32.61 
 
 		 219 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.1 
 
 		 382 aa  49.3  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  31.9 
 
 		 203 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  37.7 
 
 		 417 aa  48.5  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  26.77 
 
 		 200 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2135  hypothetical protein  25.68 
 
 		 237 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.34 
 
 		 501 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5480  hypothetical protein  31.82 
 
 		 285 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  25 
 
 		 299 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  36.89 
 
 		 916 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  29.67 
 
 		 926 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  28.48 
 
 		 291 aa  46.2  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4657  hypothetical protein  23.9 
 
 		 291 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.725594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 472 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  35.34 
 
 		 270 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 696 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0700  hypothetical protein  35.56 
 
 		 292 aa  44.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2449 aa  45.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  44.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  29.37 
 
 		 287 aa  44.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1421  hypothetical protein  26.15 
 
 		 291 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.697302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  26.32 
 
 		 285 aa  44.3  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>