20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67464 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_67464  Ca2+-modulated nonselective cation channel polycystin  100 
 
 		 969 aa  1838    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66502  hypothetical protein  46.97 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48142  chitinase 2 precursor  70.73 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  26.42 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  25.16 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  30.29 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  30.24 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00420  hypothetical protein  28.02 
 
 		 438 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  27.8 
 
 		 741 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  25.47 
 
 		 792 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67638  Fasciclin and related adhesion glycoproteins  41.8 
 
 		 393 aa  51.6  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.804506  normal  0.0159998 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28677  hyphal wall protein (putative)  38.98 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  28.42 
 
 		 767 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  28.42 
 
 		 767 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0068  hypothetical protein  29.92 
 
 		 203 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  24.29 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 792 aa  47.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  27.94 
 
 		 697 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  22.58 
 
 		 774 aa  45.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>