14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2622 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  757    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  73.42 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0181  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000347481  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4544  hypothetical protein  24.21 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0092  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  40.91 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  34.25 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.8 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  35.21 
 
 		 510 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  47.83 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  42.25 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  43.48 
 
 		 255 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0600  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.653079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>