10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4544 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4544  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0092  hypothetical protein  73.67 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000347481  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2622  hypothetical protein  25.44 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2888  hypothetical protein  25.47 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  50 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  60 
 
 		 771 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  50 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  42.19 
 
 		 1281 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>