14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1281 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  76.98 
 
 		 431 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  876    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  40.47 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0333  hypothetical protein  28.33 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3422  FHA domain-containing protein  29.49 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  43.37 
 
 		 1281 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  27.1 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  24.84 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  36.14 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  65.12 
 
 		 1034 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  60.98 
 
 		 259 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 		 771 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  43.48 
 
 		 916 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.75 
 
 		 914 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>