12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3422 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3422  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 462 aa  913    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  77.48 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  29.11 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  28.65 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  30.77 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  29.49 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  30.1 
 
 		 2311 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1927  hypothetical protein  24.07 
 
 		 333 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  25.81 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  23.38 
 
 		 899 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  23.14 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.09 
 
 		 2668 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>