31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0580 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3143  hypothetical protein  39.35 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12440  hypothetical protein  34.29 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.192453  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3464  hypothetical protein  34.25 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000205348  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2140  hypothetical protein  33.7 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5541  hypothetical protein  27.5 
 
 
461 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6583  hypothetical protein  31.69 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260944  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2868  putative lipoprotein  28.44 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000539281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0151  lipoprotein, putative  32.76 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0627  hypothetical protein  32.52 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1025  hypothetical protein  28.96 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.995963  decreased coverage  0.00250254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2555  hypothetical protein  28.3 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 
600 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  36.36 
 
 
633 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  40.96 
 
 
430 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  59.52 
 
 
431 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
771 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2167  hypothetical protein  35.8 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  31.76 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  49.28 
 
 
1394 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  48.21 
 
 
259 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  61.11 
 
 
1034 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  57.14 
 
 
625 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  43.08 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  61.11 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  62.5 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  45.76 
 
 
1281 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  51.79 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4038  hypothetical protein  33.83 
 
 
596 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  39.74 
 
 
415 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  35.14 
 
 
329 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>