37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3759 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  100 
 
 
259 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.46 
 
 
453 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  36.46 
 
 
840 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  48.24 
 
 
551 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 
846 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  52.27 
 
 
456 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  41.18 
 
 
625 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  50 
 
 
1217 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  31.48 
 
 
1028 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  37.96 
 
 
555 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  43.43 
 
 
1096 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  44.23 
 
 
504 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.2 
 
 
916 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.52 
 
 
830 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  45.19 
 
 
428 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  43.75 
 
 
914 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  41.46 
 
 
605 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  37.3 
 
 
582 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  60.98 
 
 
430 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  58.54 
 
 
431 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  43.59 
 
 
572 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  24.83 
 
 
938 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  41.86 
 
 
735 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  43.33 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  37.12 
 
 
639 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34876  predicted protein  37.3 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  52.86 
 
 
136 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  45.97 
 
 
2353 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  62.16 
 
 
628 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  40.48 
 
 
793 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.56 
 
 
1281 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 
904 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  52.24 
 
 
65 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  63.64 
 
 
1034 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 
1052 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.04 
 
 
2313 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>