43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47315 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  100 
 
 
504 aa  995    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  41.62 
 
 
1000 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  46.85 
 
 
840 aa  100  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  47.42 
 
 
617 aa  88.6  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  34.83 
 
 
590 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  32.84 
 
 
648 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  41.98 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.55 
 
 
1394 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  38.98 
 
 
136 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  47.89 
 
 
1217 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.52 
 
 
1096 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  36.84 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  36.43 
 
 
916 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  42.86 
 
 
551 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  34.56 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  40.43 
 
 
735 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  39.16 
 
 
633 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  43.08 
 
 
65 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.91 
 
 
830 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  49.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  35.62 
 
 
818 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  40.17 
 
 
467 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  43.09 
 
 
453 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  27.39 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  35.04 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  37.63 
 
 
521 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1620  hypothetical protein  40.83 
 
 
441 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  40.79 
 
 
488 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  41.67 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  29.93 
 
 
423 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  43.28 
 
 
329 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  35.29 
 
 
882 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.18 
 
 
261 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  28.12 
 
 
1461 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11401  predicted protein  36.84 
 
 
116 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.62 
 
 
2313 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.53 
 
 
671 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40917  predicted protein  33.33 
 
 
180 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.251783  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46518  predicted protein  30.39 
 
 
1081 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42154  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  30.13 
 
 
489 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  36.45 
 
 
422 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  31.03 
 
 
744 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  42.55 
 
 
527 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>