17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0528 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  872    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  76.98 
 
 		 430 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  41.27 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0333  hypothetical protein  28.63 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3422  FHA domain-containing protein  30.77 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  46.34 
 
 		 1281 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  29.11 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  59.52 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  23.39 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  58.54 
 
 		 259 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.67 
 
 		 914 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  61.9 
 
 		 1034 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1927  hypothetical protein  22.75 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 771 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  74.19 
 
 		 241 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  36.19 
 
 		 942 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  48.89 
 
 		 570 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>