65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0809 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  100 
 
 
916 aa  1845    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0810  hypothetical protein  81.22 
 
 
464 aa  706    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0826  hypothetical protein  75.57 
 
 
470 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.114737  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  79.25 
 
 
451 aa  664    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  93.89 
 
 
567 aa  859    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  31.38 
 
 
857 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  30.05 
 
 
486 aa  164  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  31.94 
 
 
458 aa  151  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  29.86 
 
 
1799 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  29.32 
 
 
550 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  27.78 
 
 
1262 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  27.66 
 
 
609 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  26.37 
 
 
958 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  30.23 
 
 
869 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  27.66 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  26.96 
 
 
568 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  26.87 
 
 
684 aa  91.3  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  41.67 
 
 
1394 aa  82.4  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51.28 
 
 
830 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.21 
 
 
671 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  27.45 
 
 
674 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  33.13 
 
 
504 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  24.83 
 
 
494 aa  61.6  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  42.42 
 
 
617 aa  61.6  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  25.2 
 
 
1000 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  41.38 
 
 
433 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  36.48 
 
 
1159 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  25.69 
 
 
648 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  47.97 
 
 
453 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35 
 
 
1096 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.62 
 
 
840 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  40.54 
 
 
428 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  60.98 
 
 
202 aa  53.5  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  38.26 
 
 
675 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.29 
 
 
582 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.18 
 
 
555 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  52.87 
 
 
456 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  30 
 
 
503 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  22.12 
 
 
590 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  26 
 
 
807 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40 
 
 
451 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 
444 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.82 
 
 
2313 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.61 
 
 
998 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  38.89 
 
 
551 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 
846 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  36.59 
 
 
1028 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.21 
 
 
455 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1447  PT repeat-containing protein  48.33 
 
 
618 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  36.79 
 
 
1380 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  48.21 
 
 
1281 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  36.89 
 
 
938 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  41.18 
 
 
329 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.17 
 
 
847 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  31 
 
 
547 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1827  cryptopsoridial mucin, large thr stretch, signal peptide sequence  45.45 
 
 
300 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  35.14 
 
 
735 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  49.12 
 
 
458 aa  45.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  28.8 
 
 
521 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  40.38 
 
 
633 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  34.41 
 
 
269 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  44.44 
 
 
528 aa  44.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45586  predicted protein  36.36 
 
 
706 aa  44.3  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  38.83 
 
 
642 aa  44.3  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>