18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1386 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  1009    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2624  hypothetical protein  86.17 
 
 
147 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  33.23 
 
 
609 aa  133  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  28.92 
 
 
458 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  30.88 
 
 
958 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  30.29 
 
 
869 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  30.12 
 
 
1262 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  31.65 
 
 
1799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  25.96 
 
 
568 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  26.15 
 
 
587 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  25.87 
 
 
684 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2294  hypothetical protein  54.65 
 
 
87 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  28.83 
 
 
486 aa  87.4  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  26.87 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2296  hypothetical protein  63.93 
 
 
71 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  30.67 
 
 
857 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2295  hypothetical protein  72.97 
 
 
38 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  24.83 
 
 
916 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>