15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1542 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  938    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  45.66 
 
 		 1262 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  43.97 
 
 		 1799 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.54 
 
 		 958 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  38.72 
 
 		 609 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.24 
 
 		 869 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  37.58 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  38.33 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  37.32 
 
 		 486 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  32.37 
 
 		 684 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  31.67 
 
 		 550 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  34.85 
 
 		 857 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  31.94 
 
 		 916 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  28.92 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  48.68 
 
 		 119 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>