15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0672 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1130    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  63.69 
 
 
857 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  64.62 
 
 
486 aa  628  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
1799 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  33.25 
 
 
568 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  33.41 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  32.51 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.73 
 
 
958 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  30.57 
 
 
869 aa  170  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  30.48 
 
 
1262 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  29.71 
 
 
609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  29.58 
 
 
916 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  24.75 
 
 
684 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  26.87 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  48.1 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>