14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0130 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  73.33 
 
 
587 aa  823    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1154    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  49.38 
 
 
958 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.97 
 
 
869 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  44.83 
 
 
609 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  39.04 
 
 
1799 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  39.46 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 
1262 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  38.74 
 
 
684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  33.25 
 
 
550 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  30.86 
 
 
486 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  31.77 
 
 
857 aa  167  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  27.55 
 
 
916 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  25.96 
 
 
494 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>