22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0103 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1398    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  43.94 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.79 
 
 		 869 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  40.53 
 
 		 587 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.71 
 
 		 958 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  39.01 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  35.81 
 
 		 1799 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  32.54 
 
 		 458 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  34.26 
 
 		 1262 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  28.1 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  25 
 
 		 550 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  26.53 
 
 		 857 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  26.06 
 
 		 494 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  26.67 
 
 		 916 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2700  hypothetical protein  35.37 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.28 
 
 		 1667 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2701  hypothetical protein  38.67 
 
 		 147 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.772872  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.39 
 
 		 2176 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0052  hypothetical protein  29.29 
 
 		 295 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1367 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  27.78 
 
 		 154 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>