40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2132 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1225    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  47 
 
 		 1024 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1314 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.59 
 
 		 1189 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  43.59 
 
 		 873 aa  151  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  40.89 
 
 		 1814 aa  144  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.77 
 
 		 1482 aa  137  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  34.8 
 
 		 2004 aa  97.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  48.91 
 
 		 882 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 2082 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.29 
 
 		 1667 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  32.37 
 
 		 1236 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  46.67 
 
 		 679 aa  77.4  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1017 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  36.84 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  50.65 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  32.62 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  57.58 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  46.67 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1367 aa  64.7  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  27.74 
 
 		 857 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  29.19 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1601 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  41.56 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  31.25 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.86 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 1184 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  40.91 
 
 		 524 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.58 
 
 		 722 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1321 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.07 
 
 		 2176 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0052  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 885 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  46.3 
 
 		 101 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.06 
 
 		 607 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  30.53 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  27.72 
 
 		 500 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2761  hypothetical protein  25.4 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2700  hypothetical protein  38.75 
 
 		 286 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>