29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1642 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1474    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0532  hypothetical protein  31.65 
 
 
402 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  42.58 
 
 
679 aa  172  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3683  hypothetical protein  33.91 
 
 
301 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.66191  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  30.82 
 
 
377 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  57.14 
 
 
1024 aa  84.7  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  52.94 
 
 
1482 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  59.46 
 
 
489 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  48.48 
 
 
873 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  55.71 
 
 
1189 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  54.55 
 
 
518 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  48.65 
 
 
1314 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  52.86 
 
 
2082 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  48.33 
 
 
646 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.46 
 
 
1236 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  32.39 
 
 
1017 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  54.29 
 
 
524 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  40 
 
 
1321 aa  57.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  36.46 
 
 
101 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  45.07 
 
 
1814 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  37.35 
 
 
885 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0409  hypothetical protein  36.69 
 
 
138 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.82 
 
 
607 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  42.86 
 
 
724 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 
1184 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0164  hypothetical protein  25.51 
 
 
400 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1112  hypothetical protein  25.17 
 
 
401 aa  50.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40 
 
 
722 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.53 
 
 
1406 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>