129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2761 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2761  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  970    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  27.76 
 
 
500 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  32.56 
 
 
2176 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  25.44 
 
 
684 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.53 
 
 
930 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  33.33 
 
 
1830 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.21 
 
 
1862 aa  63.2  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.59 
 
 
2552 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.34 
 
 
1667 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  44.62 
 
 
1528 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  30.05 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.68 
 
 
929 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  37.11 
 
 
460 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  39.76 
 
 
582 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.56 
 
 
941 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.77 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.61 
 
 
930 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  38.78 
 
 
1667 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.88 
 
 
1236 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.43 
 
 
963 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  42.86 
 
 
1231 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.53 
 
 
869 aa  57.4  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
1085 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  45.59 
 
 
870 aa  57.4  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.55 
 
 
3295 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  30.15 
 
 
958 aa  57  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.03 
 
 
1282 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  37.36 
 
 
1042 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  33.98 
 
 
910 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.76 
 
 
2554 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.02 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  32.88 
 
 
525 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.96 
 
 
859 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.76 
 
 
861 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  36.44 
 
 
816 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  37.37 
 
 
400 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  43.1 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  43.55 
 
 
865 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 
1732 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.54 
 
 
1361 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  43.55 
 
 
2000 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  42.31 
 
 
940 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.08 
 
 
786 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.26 
 
 
1092 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  45.45 
 
 
1387 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.46 
 
 
530 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  48.28 
 
 
802 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.1 
 
 
845 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  41.25 
 
 
669 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  44.07 
 
 
644 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  45 
 
 
443 aa  54.3  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
719 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  49.12 
 
 
848 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  39.39 
 
 
1969 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  47.46 
 
 
1356 aa  53.9  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  40.26 
 
 
587 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  41.3 
 
 
918 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.68 
 
 
1094 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.79 
 
 
679 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  44.07 
 
 
581 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  46.43 
 
 
615 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.13 
 
 
2122 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  35.53 
 
 
551 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  44.07 
 
 
752 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.85 
 
 
1682 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.55 
 
 
819 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  44.07 
 
 
769 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.68 
 
 
713 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.68 
 
 
658 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  35.06 
 
 
1300 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32 
 
 
1120 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  35.71 
 
 
1189 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  40.68 
 
 
1096 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34 
 
 
2036 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.98 
 
 
594 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.96 
 
 
823 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.67 
 
 
561 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.97 
 
 
838 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  40.68 
 
 
1531 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  38.27 
 
 
840 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  30.33 
 
 
978 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.64 
 
 
575 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  40.24 
 
 
952 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  48.21 
 
 
1095 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  36 
 
 
235 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  36.56 
 
 
439 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 
1158 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.47 
 
 
1783 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.68 
 
 
735 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  42.37 
 
 
675 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.68 
 
 
2272 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.38 
 
 
1842 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  43.1 
 
 
547 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.68 
 
 
685 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  36.51 
 
 
791 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.66 
 
 
1814 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  32.22 
 
 
869 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  45.76 
 
 
787 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  35.29 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.68 
 
 
1882 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>