212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2607 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2607  PKD  100 
 
 
235 aa  487  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.37 
 
 
1528 aa  82.4  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  42.39 
 
 
1095 aa  78.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  59.02 
 
 
870 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  56.25 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.13 
 
 
1862 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  58.33 
 
 
1356 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  51.52 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  54.84 
 
 
2122 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  53.03 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  54.69 
 
 
941 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  60 
 
 
978 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  56.67 
 
 
845 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 
3295 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.17 
 
 
2272 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  51.39 
 
 
2036 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  51.39 
 
 
1969 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  51.56 
 
 
2000 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  54.55 
 
 
1667 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46.34 
 
 
1236 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  44.32 
 
 
1092 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  62.5 
 
 
1096 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  56.67 
 
 
575 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  41.05 
 
 
963 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  52.31 
 
 
1300 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  46.15 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.93 
 
 
1732 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  47.76 
 
 
1120 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  43.04 
 
 
2176 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  51.47 
 
 
840 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  50 
 
 
2552 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  33.52 
 
 
465 aa  68.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  55.17 
 
 
910 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 
2554 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  53.97 
 
 
615 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  55 
 
 
1842 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  52.94 
 
 
1667 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  55 
 
 
1682 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 
1380 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  46.34 
 
 
1162 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50 
 
 
1361 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  49.33 
 
 
769 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  55 
 
 
861 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  54.1 
 
 
869 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  54.1 
 
 
802 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  48.15 
 
 
684 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  48.48 
 
 
1241 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  45.88 
 
 
1311 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  55.93 
 
 
865 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  58.33 
 
 
1830 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  50 
 
 
675 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.24 
 
 
1931 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.33 
 
 
1085 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  50 
 
 
551 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  37.17 
 
 
816 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  50.79 
 
 
1189 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  50 
 
 
848 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.75 
 
 
735 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  53.33 
 
 
1882 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  49.25 
 
 
644 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  50 
 
 
1282 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  50.79 
 
 
567 aa  65.1  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.97 
 
 
791 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.48 
 
 
752 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.16 
 
 
958 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  55 
 
 
587 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  52.54 
 
 
1042 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  50 
 
 
838 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  50.79 
 
 
1094 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.01 
 
 
1783 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  50.75 
 
 
719 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  46.25 
 
 
1231 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 
594 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.5 
 
 
530 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  51.61 
 
 
777 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.58 
 
 
823 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.45 
 
 
669 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  44.59 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  40.24 
 
 
561 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  40 
 
 
787 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.84 
 
 
786 aa  62  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  48.33 
 
 
685 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.56 
 
 
625 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.06 
 
 
930 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.94 
 
 
713 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.45 
 
 
658 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.48 
 
 
930 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  53.33 
 
 
1001 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3042  PKD  44.59 
 
 
428 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.971034  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  54.24 
 
 
940 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  48.44 
 
 
560 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.94 
 
 
679 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  51.72 
 
 
528 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  45.45 
 
 
561 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  52.46 
 
 
929 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45.45 
 
 
581 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  45.31 
 
 
859 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  42.31 
 
 
819 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  42.86 
 
 
952 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  48.33 
 
 
971 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>