More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0125 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0130  protease, putative  72.87 
 
 
935 aa  1281    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  77.64 
 
 
865 aa  1375    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  76.64 
 
 
871 aa  1335    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  56.66 
 
 
951 aa  882    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  58.75 
 
 
951 aa  935    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  77.91 
 
 
871 aa  1363    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  77.23 
 
 
867 aa  1368    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  75.82 
 
 
936 aa  1296    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
869 aa  1788    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  76.3 
 
 
936 aa  1304    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  76.16 
 
 
856 aa  1319    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  56.62 
 
 
965 aa  946    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  56.51 
 
 
938 aa  923    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  55.01 
 
 
945 aa  912    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  52.39 
 
 
938 aa  848    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  57.06 
 
 
865 aa  972    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  38.77 
 
 
918 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  34.03 
 
 
751 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.18 
 
 
795 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.18 
 
 
795 aa  349  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.27 
 
 
796 aa  347  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  31.67 
 
 
796 aa  347  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  31.15 
 
 
796 aa  346  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.35 
 
 
795 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  31.71 
 
 
795 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  31.71 
 
 
795 aa  343  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.71 
 
 
795 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  31.71 
 
 
795 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  31.61 
 
 
794 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  31.22 
 
 
795 aa  341  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32 
 
 
812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  31.91 
 
 
794 aa  336  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  31.79 
 
 
795 aa  330  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  32.05 
 
 
795 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  30.95 
 
 
799 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  30.35 
 
 
799 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  30.35 
 
 
799 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  30.55 
 
 
796 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  30.35 
 
 
799 aa  321  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  30.35 
 
 
799 aa  321  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  30.22 
 
 
799 aa  319  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  30.22 
 
 
799 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  30.09 
 
 
799 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  30.09 
 
 
799 aa  317  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  31.44 
 
 
795 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  30.92 
 
 
770 aa  207  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  29.9 
 
 
764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  29.94 
 
 
763 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  30 
 
 
763 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  27.88 
 
 
781 aa  197  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  28.98 
 
 
771 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.48 
 
 
927 aa  191  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.17 
 
 
1045 aa  191  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.75 
 
 
744 aa  181  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  30.18 
 
 
746 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  26.51 
 
 
768 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.27 
 
 
806 aa  174  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  29.85 
 
 
760 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.43 
 
 
747 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  22.93 
 
 
924 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  26.66 
 
 
825 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  24.33 
 
 
811 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  29.02 
 
 
566 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.54 
 
 
918 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  27.86 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  58.54 
 
 
2066 aa  73.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  25.14 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.35 
 
 
699 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.83 
 
 
945 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  57.14 
 
 
3197 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  51.61 
 
 
1150 aa  68.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  45.88 
 
 
967 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.07 
 
 
1027 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  50 
 
 
852 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  44.44 
 
 
840 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  53.23 
 
 
3197 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  46.15 
 
 
1151 aa  65.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  37.37 
 
 
1194 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.12 
 
 
1200 aa  64.7  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 
1158 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.15 
 
 
940 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  41.24 
 
 
317 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  53.16 
 
 
1667 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  45.68 
 
 
960 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  45.68 
 
 
960 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  43.18 
 
 
816 aa  63.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  45.24 
 
 
948 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.67 
 
 
953 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.38 
 
 
773 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  47.37 
 
 
873 aa  62  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  45.98 
 
 
1565 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  35.07 
 
 
1830 aa  61.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  62 
 
 
884 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  48.05 
 
 
818 aa  61.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  58.18 
 
 
712 aa  61.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.99 
 
 
1096 aa  60.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  44.05 
 
 
944 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  32.99 
 
 
1028 aa  60.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  44.05 
 
 
944 aa  61.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  29.33 
 
 
735 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>